[صفحه اصلی ]   [ English ]   مشاهده مقالات :: - 1393/12/10 - جلد:۱۷ - شماره:۱ - 2015/03/1 - Volume:۱۷ - Number:۱ :: زبان مقاله منتشر شده fa عنوان انگلیسی Mycobacterium tuberculosis genotyping by MIRU-VNTR method عنوان فارسی تعيين ساختار ژنتيکی مايکوباکتريوم توبرکلوزيس به روش MIRU-VNTR عنوان مختصر کد مقاله (doi) موضوعات مقاله منتشر شده Microbiology نوع مقاله منتشر شده Descriptive Study چکیده انگلیسی مقاله Background and Objective: MIRU-VNTR typing is currently one of the most frequently-used standardized genotyping systems in molecular epidemiology of tuberculosis in the world. This sudy was done to determine the Mycobacterium tuberculosis genotyping by MIRU-VNTR method. Methods: This descriptive study was done on sputum, gastric lavage clinical specimens of 53 tuberculosis suspected patients. Fifty-three isolates were identified by 16S rRNA and Rv-typing followed by RD typing. They were then subjected to a 12-locus (ETRA, ETRB, ETRC, ETRD, ETRE and ETRF, MIRU-10, MIRU-26, MIRU-39, MIRU-30 plus QUB-11b) MIRU-VNTR typing system. Results: In MIRU-VNTR typing, forty-four types were identified with 13 isolates classified in 4 clustered and the remaining 40 isolates representing 40 orphan patterns. In comparative analysis of MIRU-VNTR loci, MIRU-26 with 7 alleles displayed the highest diversity level (Simpson’s diversity index = 0.767. Out of the 53 isolates, only one was identified as Mycobacterium bovis. All the remaining isolates were characterized as Mycobacterium tuberculosis. None of the samples was affected to Mycobacterium complex strain. No evidence of either double or co-infection of the patients with more than one species/strain was detected. Conclusion: While the genomic diversity observed by MIRU-VNTR typing sounds extensive, the population genomic structure on the whole however, seems to be homogenous. Recent transmission between studied patients does not appear to be a frequent event as only 13 isolates representing 4 MIRU-VNTR types, were assumingly epidemic. چکیده فارسی مقاله زمينه و هدف : روش MIRU-VNTR به يکی از فراگيرترين روش‌های استاندارد شده ژنوتايپينگ مايکوباکتريوم توبرکلوزيس کمپلکس تبديل شده است. اين مطالعه به منظور تعيين ساختار ژنتيکی مايکوباکتريوم توبرکلوزيس به روش MIRU-VNTR و نيز تعيين نقش اعضای ديگر مايکوباکتريوم توبرکلوزيس کمپلکس در ايجاد بيماری سل انجام گرديد. روش بررسی : اين مطالعه توصيفی روی 53 جدايه حاصل از کشت باکتريايی نمونه‌های خلط و لاواژ معدی بيماران مشکوک به بيماری سل انجام شد. به منظور تعيين هويت جدايه‌ها در ابتدا از آزمون‌های 16S rRNA و Rv Typing و در مرحله بعد از آزمون RD typing استفاده شد. سپس با به‌کارگيری 12 لوکوس شناخته شده MIRU-VNTR typing ژنوتايپ جدايه‌ها مشخص گرديد. يافته‌ها : در مجموع 44 تيپ ژنتيکی مورد شناسايی قرار گرفت. به‌طوری که 13 جدايه در 4 تيپ ژنتيکی به‌صورت مشترک يک ژنوتيپ را از خود نشان دادند و 40 تيپ ژنتيکی هر کدام فقط توسط يک جدايه نمايش داده شدند. در مقايسه ميان لوکوس‌های 12 گانه MIRU-VNTR از نظر قدرت تفريق مشخص گرديد MIRU-26 با 7 آلل قدرتمندترين توان افتراق ميان جدايه‌ها را از خود نشان داده است. به طوری که Simpson’s diversity index در اين لوکوس عدد 0.767 بود. به‌جز يک جدايه با هويت مايکوباکتريوم بوويس، 52 جدايه ديگر مايکوباکتريوم توبرکلوزيس بودند. هيچ‌يک از نمونه‌ها به ساير اعضای مايکوباکتريوم توبرکلوزيس کمپلکس آلوده نبودند. همچنين آلودگی همزمان نمونه‌ها به بيش از دو سويه مشاهده نشد. نتيجه‌گيری : اگرچه 42 تيپ ژنتيکی MIRU-VNTR در ميان 53 جدايه تحت مطالعه شناسايی شد؛ اما دستکم در 19 مورد تفاوت ميان اين تيپ‌ها، فقط در مورد يک لوکوس از 12 لوکوس به‌کاررفته مشاهده گرديد. بدين ترتيب در مجموع جمعيت ژنتيکی نسبتاً همگنی از جدايه‌ها مشاهده گرديد. اگرچه شناسايی 13 جدايه اپيدميک در قالب 4 تيپ ژنتيکی می‌تواند به عنوان نشانه انتقال بيماری در ميان مبتلايان باشد؛ اما در مجموع انتقال بيماری در بيماران تحت بررسی چندان گسترده به‌نظر نمی‌رسد. کلیدواژه‌های انگلیسی مقاله Mycobacterium tuberculosis complex, Mycobacterium bovis, RD typing, Rv-typing, MIRU-VNTR genotype کلیدواژه‌های فارسی مقاله مايکوباکتريوم توبرکلوزيس کمپلکس , مايکوباکتريوم بوويس , RD typing , Rv typing , MIRU-VNTR genotyping صفحه آغاز مقاله در نشریه ۹۷ صفحه پایان مقاله در نشریه ۱۰۷ نشانی اینترنتی http:///browse.php?a_code=A-10-1-811&slc_lang=fa&sid=fa فایل مقاله فایلی برای مقاله ذخیره نشده است نویسندگان مقاله 7068---7069---7070---7071---7072---7073---7074---7075---7076---7077--- برای برگشت به بخش مقاله‌های منتشر شده اینجا را کلیک كنید. Persian site map - English site map - Created in 0.09 seconds with 16 queries by YEKTAWEB 4758